जनार्दन शर्मा प्रभाकरको प्रमुख राजनीतिक उद्देश्य सामाजिक न्याय, समावेशी विकास, र लोकतान्त्रिक प्रक्रिया सुदृढ गर्नु हो। उनले नेपालको ग्रामीण क्षेत्र र पिछडिएका समुदायहरूको पक्षमा आवाज उठाउँदै आएका छन्। उनले एक सशक्त, समावेशी र समान अवसरयुक्त समाजको परिकल्पना गरेका छन्, जहाँ प्रत्येक नागरिकलाई आफ्नो अधिकार र सम्मान प्राप्त होस्। उनका प्राथमिकतामा लोडसेडिङको समस्या समाधान, आधारभूत पूर्वाधार विकास, र जनताको जीवनस्तर सुधार गर्नका लागि द्रुत कदम उठाउनु रहेको छ।
साथै, उनले नेपालको ऊर्जा, स्वास्थ्य, र शिक्षा क्षेत्रको समृद्धिका लागि प्रतिबद्धता जनाएका छन्। उनका लागि आर्थिक विकास र सामाजिक समृद्धि यिनै विषयहरूमा आधारित छन्। नेपालका कागजी भिजनहरू भन्दा पनि, उनले व्यावहारिक र समावेशी योजना र नीति निर्माणमा रुचि राख्छन्।